巡城察院的御史们虽然是从都察院派出来的，但是巡城察院五御史和五城兵马司的五个指挥使一样，都是直接受命于皇上，五御史对五指挥使具有监督和弹劾权力，某种意义上来说，和两淮巡盐御史一样，都是隶属于皇帝的自留地。